O Authenticus usa um algoritmo multi-critério de classificação, desenvolvido por Sylwia Bugla e Fernando Silva, que visa associar autores a investigadores e instituições. Para cada autor de uma publicação, o algoritmo seleciona investigadores candidatos, com base em regras de construção de nomes, e para cada candidato, calcula uma medida de semelhança a partir de um conjunto de parâmetros, nomeadamente nomes de autores, emails, endereços institucionais, nomes de revistas e conferências, sub-áreas científicas, palavras chave e lista de co-autores. O candidato que apresente o valor de semelhança mais elevado que, simultaneamente, seja superior a um valor de referência, considera-se como sendo o investigador que identifica o autor. As identificações feitas pelo algoritmo deverão ser posteriormente confirmadas pelos próprios investigadores, contribuindo desse modo para que se possa obter uma base de dados certificada de publicações portuguesas.

Logo que possível, serão dados mais detalhes sobre o algoritmo.