1
TÍTULO: Integrating statistical significance and discriminative power in pattern discovery  Full Text
AUTORES: Alexandre, Leonardo; Costa, Rafael S.; Henriques, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: KNOWLEDGE-BASED SYSTEMS, VOLUME: 316
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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2
TÍTULO: A Physics-Informed Neural Network (Pinn) Framework for Generic Bioreactor Modelling
AUTORES: Monesh Kumar; José Pinto; Ekaterina Moskovkina; Rafael Costa; Rui Oliveira;
PUBLICAÇÃO: 2025
INDEXADO EM: CrossRef
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3
TÍTULO: A Physics-Informed Neural Network (PINN) framework for generic bioreactor modelling
AUTORES: Thirugnanasambandam, Monesh Kumar; Pinto, Jose; Moskovkina, Ekaterina; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: COMPUTERS & CHEMICAL ENGINEERING, VOLUME: 203
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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4
TÍTULO: Bioprocess Control with Physics-Informed Neural Networks: Driving Microbiome Evolution Toward High Polyhydroxyalkanoates Production Capacity
AUTORES: Marta Catalão; José Pinto; Cristiana A.V Torres; Filomena Freitas; Maria A.M Reis; Rafael Costa; Rui Oliveira;
PUBLICAÇÃO: 2025
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5
TÍTULO: TriSig: Evaluating the statistical significance of triclusters
AUTORES: Alexandre, Leonardo; Costa, Rafael S.; Henriques, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: PATTERN RECOGNITION, VOLUME: 149
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 1
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6
TÍTULO: Pattern-centric transformation of omics data grounded on discriminative gene associations aids predictive tasks in TCGA while ensuring interpretability
AUTORES: Patricio, Andre; Costa, Rafael S.; Henriques, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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7
TÍTULO: SBML2HYB: a Python interface for SBML compatible hybrid modeling
AUTORES: Pinto, Jose; Costa, Rafael S.; Alexandre, Leonardo; Ramos, Joao; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: BIOINFORMATICS, VOLUME: 39, NÚMERO: 1
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 2
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8
TÍTULO: A General Hybrid Modeling Framework for Systems Biology Applications: Combining Mechanistic Knowledge with Deep Neural Networks under the SBML Standard
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: AI, VOLUME: 4, NÚMERO: 1
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 8
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9
TÍTULO: On the challenges of predicting treatment response in Hodgkin’s Lymphoma using transcriptomic data
AUTORES: André Patrício; Rafael Costa; Rui Henriques;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: BMC Medical Genomics, VOLUME: 16, NÚMERO: S1
INDEXADO EM: Scopus CrossRef: 1
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10
TÍTULO: Hybrid Deep Modeling of a GS115 (Mut+) Pichia pastoris Culture with State-Space Reduction
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FERMENTATION-BASEL, VOLUME: 9, NÚMERO: 7
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 2
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