1
TÍTULO: TriSig: Evaluating the statistical significance of triclusters
AUTORES: Alexandre, Leonardo; Costa, Rafael S.; Henriques, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: PATTERN RECOGNITION, VOLUME: 149
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 1
NO MEU: ORCID
2
TÍTULO: Pattern-centric transformation of omics data grounded on discriminative gene associations aids predictive tasks in TCGA while ensuring interpretability
AUTORES: Patricio, Andre; Costa, Rafael S.; Henriques, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
NO MEU: ORCID
3
TÍTULO: SBML2HYB: a Python interface for SBML compatible hybrid modeling
AUTORES: Pinto, Jose; Costa, Rafael S.; Alexandre, Leonardo; Ramos, Joao; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: BIOINFORMATICS, VOLUME: 39, NÚMERO: 1
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 2
NO MEU: ORCID
4
TÍTULO: A General Hybrid Modeling Framework for Systems Biology Applications: Combining Mechanistic Knowledge with Deep Neural Networks under the SBML Standard
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: AI, VOLUME: 4, NÚMERO: 1
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 8
NO MEU: ORCID
5
TÍTULO: On the challenges of predicting treatment response in Hodgkin’s Lymphoma using transcriptomic data
AUTORES: André Patrício; Rafael Costa; Rui Henriques;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: BMC Medical Genomics, VOLUME: 16, NÚMERO: S1
INDEXADO EM: Scopus CrossRef: 1
NO MEU: ORCID
6
TÍTULO: Hybrid Deep Modeling of a GS115 (Mut+) Pichia pastoris Culture with State-Space Reduction
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FERMENTATION-BASEL, VOLUME: 9, NÚMERO: 7
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 2
NO MEU: ORCID
7
TÍTULO: An Overview of Mathematical Modelling in Cancer Research: Fractional Calculus as Modelling Tool
AUTORES: Vieira, Lourenco Corte; Costa, Rafael S.; Valerio, Duarte;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FRACTAL AND FRACTIONAL, VOLUME: 7, NÚMERO: 8
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 7
NO MEU: ORCID
8
TÍTULO: Hybrid deep modeling of a CHO-K1 fed-batch process: combining first-principles with deep neural networks
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Rossell, Sergio; Dumas, Patrick; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY, VOLUME: 11
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 5
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9
TÍTULO: Predicting metabolic fluxes from omics data via machine learning: Moving from knowledge-driven towards data-driven approaches
AUTORES: Daniel Gonçalves; Rui Henriques; Rafael Costa;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: Computational and Structural Biotechnology Journal, VOLUME: 21
INDEXADO EM: Scopus CrossRef: 1
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