Rui Manuel Freitas Oliveira
AuthID: R-000-FXV
1
TÃTULO: Incorporating first-principles information into hybrid modeling structures: Comparing hybrid semi-parametric models with Physics-Informed Recurrent Neural Networks
AUTORES: Jul Rasmussen, Peter; Kumar, Monesh; Pinto, Jose; Oliveira, Rui; Liang, Xiaodong; Huusom, Jakob Kjobsted;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: COMPUTERS & CHEMICAL ENGINEERING, VOLUME: 199
AUTORES: Jul Rasmussen, Peter; Kumar, Monesh; Pinto, Jose; Oliveira, Rui; Liang, Xiaodong; Huusom, Jakob Kjobsted;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: COMPUTERS & CHEMICAL ENGINEERING, VOLUME: 199
2
TÃTULO: A Physics-Informed Neural Network (PINN) framework for generic bioreactor modelling
AUTORES: Thirugnanasambandam, Monesh Kumar; Pinto, Jose; Moskovkina, Ekaterina; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: COMPUTERS & CHEMICAL ENGINEERING, VOLUME: 203
AUTORES: Thirugnanasambandam, Monesh Kumar; Pinto, Jose; Moskovkina, Ekaterina; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: COMPUTERS & CHEMICAL ENGINEERING, VOLUME: 203
3
TÃTULO: A Review of Intelligent Modeling for Microalgae Systems: Integrating Data Mining, Machine Learning, and Hybrid Approaches
AUTORES: Geovani R Freitas; Sara Badenes; Rui Oliveira; F. G. Martins;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: Processes, VOLUME: 13, NÚMERO: 9
AUTORES: Geovani R Freitas; Sara Badenes; Rui Oliveira; F. G. Martins;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: Processes, VOLUME: 13, NÚMERO: 9
4
TÃTULO: Deep hybrid modeling of a HEK293 process: Combining long short-term memory networks with first principles equations Full Text
AUTORES: Ramos, Joao R. C.; Pinto, Jose; Gil Poiares-Oliveira ; Peeters, Ludovic; Dumas, Patrick; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING, VOLUME: 121, NÚMERO: 5
AUTORES: Ramos, Joao R. C.; Pinto, Jose; Gil Poiares-Oliveira ; Peeters, Ludovic; Dumas, Patrick; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING, VOLUME: 121, NÚMERO: 5
5
TÃTULO: SBML2HYB: a Python interface for SBML compatible hybrid modeling
AUTORES: Pinto, Jose; Costa, Rafael S.; Alexandre, Leonardo; Ramos, Joao; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: BIOINFORMATICS, VOLUME: 39, NÚMERO: 1
AUTORES: Pinto, Jose; Costa, Rafael S.; Alexandre, Leonardo; Ramos, Joao; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: BIOINFORMATICS, VOLUME: 39, NÚMERO: 1
6
TÃTULO: A General Hybrid Modeling Framework for Systems Biology Applications: Combining Mechanistic Knowledge with Deep Neural Networks under the SBML Standard
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: AI, VOLUME: 4, NÚMERO: 1
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: AI, VOLUME: 4, NÚMERO: 1
7
TÃTULO: Hybrid Deep Modeling of a GS115 (Mut+) Pichia pastoris Culture with State-Space Reduction
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FERMENTATION-BASEL, VOLUME: 9, NÚMERO: 7
AUTORES: Pinto, Jose; Ramos, Joao R. C.; Costa, Rafael S.; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FERMENTATION-BASEL, VOLUME: 9, NÚMERO: 7
8
TÃTULO: Upcycling of food waste streams to valuable biopigments pyocyanin and 1-hydroxyphenazine Full Text
AUTORES: Pantelic, Lena; Bogojevic, Sanja Skaro; Vojnovic, Sandra; Oliveira, Rui; Lazic, Jelena; Ilic Tomic, Tatjana; Milivojevic, Dusan; Nikodinovic Runic, Jasmina;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY, VOLUME: 171
AUTORES: Pantelic, Lena; Bogojevic, Sanja Skaro; Vojnovic, Sandra; Oliveira, Rui; Lazic, Jelena; Ilic Tomic, Tatjana; Milivojevic, Dusan; Nikodinovic Runic, Jasmina;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: ENZYME AND MICROBIAL TECHNOLOGY, VOLUME: 171
INDEXADO EM: 
Scopus 
WOS
Scopus WOS9
TÃTULO: From Shallow to Deep Bioprocess Hybrid Modeling: Advances and Future Perspectives
AUTORES: Agharafeie, Roshanak; Ramos, Joao Rodrigues Correia; Mendes, Jorge M. ; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FERMENTATION-BASEL, VOLUME: 9, NÚMERO: 10
AUTORES: Agharafeie, Roshanak; Ramos, Joao Rodrigues Correia; Mendes, Jorge M. ; Oliveira, Rui;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: FERMENTATION-BASEL, VOLUME: 9, NÚMERO: 10
10
TÃTULO: A General SBML Compatible Hybrid Modeling Framework: Combining Biochemical Mechanisms with Deep Neural Networks for Systems Biology Applications
AUTORES: José Pinto; João R C Ramos; Rafael S Costa; Rui Oliveira;
PUBLICAÇÃO: 2023
AUTORES: José Pinto; João R C Ramos; Rafael S Costa; Rui Oliveira;
PUBLICAÇÃO: 2023
