11
TÍTULO: BioISO: An Objective-Oriented Application for Assisting the Curation of Genome-Scale Metabolic Models
AUTORES: Cruz, Fernando; Capela, Joao; Ferreira, Eugenio Campos; Rocha, Miguel ; Dias, Oscar ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, VOLUME: 21, NÚMERO: 2
INDEXADO EM: WOS CrossRef: 2
12
TÍTULO: Deepmol: an automated machine and deep learning framework for computational chemistry  Full Text
AUTORES: Correia, Joao; Capela, Joao; Rocha, Miguel ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF CHEMINFORMATICS, VOLUME: 16, NÚMERO: 1
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 16
13
TÍTULO: Metabolic modelling reveals key pathways in COVID-19 in an effort to drive drug purposing
AUTORES: Oliveira, Alexandre; Rocha, Miguel ; Dias, Oscar ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: 10th IFAC Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering (FOSBE) in IFAC PAPERSONLINE, VOLUME: 58, NÚMERO: 23
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 1 Handle
14
TÍTULO: MOSCA 2.0: A bioinformatics framework for metagenomics, metatranscriptomics and metaproteomics data analysis and visualization
AUTORES: Sequeira, Joao C.; Pereira, Vitor ; Alves, M. Madalena; Pereira, M. Alcina ; Rocha, Miguel ; Salvador, Andreia F.;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
15
TÍTULO: PENGUIN: A rapid and efficient image preprocessing tool for multiplexed spatial proteomics
AUTORES: Sequeira, A. M.; Ijsselsteijn, M. E.; Rocha, M. ; Miranda, Noel F. C. C. de;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, VOLUME: 23
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 4
16
TÍTULO: Reconstruction of cell-specific models capturing the influence of metabolism on DNA methylation in cancer  Full Text
AUTORES: Barata, Thnia; Pereira, Vitor ; das Neves, Ricardo Pires; Rocha, Miguel ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, VOLUME: 170
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
17
TÍTULO: A systematic evaluation of deep learning methods for the prediction of drug synergy in cancer  Full Text
AUTORES: Baptista, Delora; Ferreira, Pedro G. ; Rocha, Miguel ;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, VOLUME: 19, NÚMERO: 3
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 26
18
TÍTULO: Combining Evolutionary Algorithms With Reaction Rules Towards Focused Molecular Design
AUTORES: Correia, Joao; Pereira, Vitor ; Rocha, Miguel ;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: Genetic and Evolutionary Computation Conference (GECCO) in PROCEEDINGS OF THE 2023 GENETIC AND EVOLUTIONARY COMPUTATION CONFERENCE, GECCO 2023
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
19
TÍTULO: Preface
AUTORES: Fdez Riverola, F; Rocha, M ; Mohamad, MS; Caraiman, S; Gil González, AB;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: 16th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2022 in Lecture Notes in Networks and Systems, VOLUME: 553
INDEXADO EM: Scopus
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TÍTULO: The first multi-tissue genome-scale metabolic model of a woody plant highlights suberin biosynthesis pathways in Quercus suber  Full Text
AUTORES: Cunha, Emanuel; Silva, Miguel; Chaves, Ines; Demirci, Huseyin; Lagoa, Davide Rafael; Lima, Diogo; Rocha, Miguel ; Rocha, Isabel; Dias, Oscar ;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, VOLUME: 19, NÚMERO: 9
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 2 Handle
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