Oscar Manuel Lima Dias


AuthID: R-000-DYT

Publicações Confirmadas: 55



1
TÍTULO: Comparative Assessment of Protein Large Language Models for Enzyme Commission Number Prediction  Full Text
AUTORES: Capela, Joao; Zimmermann Kogadeeva, Maria; van Dijk, Aalt D. J.; de Ridder, Dick; Dias, Oscar ; Rocha, Miguel;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: BMC BIOINFORMATICS, VOLUME: 26, NÚMERO: 1
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 2
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2
TÍTULO: PhageDPO: A machine-learning based computational framework for identifying phage depolymerases  Full Text
AUTORES: Fernanda Vieira; José Duarte; Rita Domingues; Hugo Oliveira; Oscar Dias ;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: Computers in Biology and Medicine, VOLUME: 188
INDEXADO EM: Scopus CrossRef
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3
TÍTULO: A diel multi-tissue genome-scale metabolic model of Vitis vinifera  Full Text
AUTORES: Marta Sampaio; Miguel Rocha; Oscar Dias ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: PLOS Computational Biology, VOLUME: 20, NÚMERO: 10
INDEXADO EM: CrossRef: 2
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4
TÍTULO: BioISO: An Objective-Oriented Application for Assisting the Curation of Genome-Scale Metabolic Models
AUTORES: Cruz, Fernando; Capela, Joao; Ferreira, Eugenio Campos; Rocha, Miguel ; Dias, Oscar ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, VOLUME: 21, NÚMERO: 2
INDEXADO EM: WOS CrossRef: 2
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5
TÍTULO: BioISO: An Objective-Oriented Application for Assisting the Curation of Genome-Scale Metabolic Models
AUTORES: Fernando Cruz; Joao Capela; Eugenio Campos Ferreira ; Miguel Rocha ; Oscar Dias ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, VOLUME: 21, NÚMERO: 2
INDEXADO EM: Scopus CrossRef: 1
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6
TÍTULO: Optimization of chondroitin production in E. coli using genome scale models
AUTORES: Couto, Marcia R.; Rodrigues, Joana L.; Braga, Adelaide; Dias, Oscar ; Rodrigues, Ligia R. ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: MOLECULAR SYSTEMS DESIGN & ENGINEERING, VOLUME: 9, NÚMERO: 6
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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7
TÍTULO: Saccharomyces cerevisiae as a Host for Chondroitin Production
AUTORES: Márcia R Couto; Joana L Rodrigues; Oscar Dias ; Lígia R Rodrigues ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: SynBio, VOLUME: 2, NÚMERO: 2
INDEXADO EM: CrossRef
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8
TÍTULO: Towards a genome-scale metabolic model of Dunaliella salina
AUTORES: Cunha, Emanuel; Sousa, Vitor; Vicente, Antonio; Geada, Pedro; Dias, Oscar ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: 10th IFAC Conference on Foundations of Systems Biology in Engineering (FOSBE) in IFAC PAPERSONLINE, VOLUME: 58, NÚMERO: 23
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 1
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9
TÍTULO: Exploring Xylella fastidiosa’s Metabolic Traits Using a GSM Model of the Phytopathogenic Bacterium
AUTORES: Oliveira, A; Cunha, E; Silva, M; Faria, C; Dias, O ;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: 16th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2022 in Lecture Notes in Networks and Systems, VOLUME: 553
INDEXADO EM: Scopus CrossRef: 1
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10
TÍTULO: In Silico Design of Saccharomyces cerevisiae Strains for Improved Production of Chondroitin
AUTORES: Márcia R Couto; Joana L Rodrigues; Oscar Dias ; Lígia R Rodrigues ;
PUBLICAÇÃO: 2023
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