Jorge Manuel de Sousa Basto Vieira


AuthID: R-000-7S2

Publicações Confirmadas: 124



1
TÍTULO: PPI Prediction from Sequences via Transfer Learning on Balanced but yet Biased Datasets: An Open Problem
AUTORES: Alba Nogueira Rodríguez; Daniel Glez Peña; Cristina Vieira; Jorge Vieira ; Hugo López Fernández;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: 18th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2024 in Lecture Notes in Networks and Systems, VOLUME: 1350 LNNS
INDEXADO EM: Scopus CrossRef
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2
TÍTULO: Predicting Which Mitophagy Proteins Are Dysregulated in Spinocerebellar Ataxia Type 3 (SCA3) Using the Auto-p2docking Pipeline  Full Text
AUTORES: Vieira, Jorge ; Barros, Mariana; Lopez Fernandez, Hugo; Glez Pena, Daniel; Nogueira Rodriguez, Alba; Vieira, Cristina P.;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, VOLUME: 26, NÚMERO: 3
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
NO MEU: ORCID | CIÊNCIAVITAE
3
TÍTULO: Towards a more accurate and reliable evaluation of machine learning protein-protein interaction prediction model performance in the presence of unavoidable dataset biases
AUTORES: Nogueira Rodriguez, Alba; Glez Pena, Daniel; Vieira, Cristina P. ; Vieira, Jorge ; Lopez Fernandez, Hugo;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS
INDEXADO EM: WOS CrossRef
NO MEU: ORCID
4
TÍTULO: Auto-phylo v2 and auto-phylo-pipeliner: building advanced, flexible, and reusable pipelines for phylogenetic inferences, estimation of variability levels and identification of positively selected amino acid sites
AUTORES: Lopez Fernandez, Hugo; Pinto, Miguel; Vieira, Cristina P. ; Duque, Pedro; Reboiro Jato, Miguel; Vieira, Jorge ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, VOLUME: 21, NÚMERO: 2
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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5
TÍTULO: Inferences on the evolution of the ascorbic acid synthesis pathway in insects using Phylogenetic Tree Collapser (PTC), a tool for the automated collapsing of phylogenetic trees using taxonomic information
AUTORES: Glez Pena, Daniel; Lopez Fernandez, Hugo; Duque, Pedro; Vieira, Cristina P.; Vieira, Jorge ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, VOLUME: 21, NÚMERO: 2
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 1
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6
TÍTULO: Multiple Lines of Evidence Support 199 SARS-CoV-2 Positively Selected Amino Acid Sites  Full Text
AUTORES: Ferreira, Pedro ; Soares, Ricardo; Lopez Fernandez, Hugo; Vazquez, Noe; Reboiro Jato, Miguel; Vieira, Cristina P.; Vieira, Jorge ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, VOLUME: 25, NÚMERO: 4
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
NO MEU: CIÊNCIAVITAE
7
TÍTULO: SEDA 2024 update: enhancing the SEquence DAtaset builder for seamless integration into automated data analysis pipelines  Full Text
AUTORES: Reboiro Jato, Miguel; Perez Rodriguez, Daniel; Da Silva, Miguel Jose; Vila Fernandez, David; Vieira, Cristina P.; Vieira, Jorge ; Lopez Fernandez, Hugo;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: BMC BIOINFORMATICS, VOLUME: 25, NÚMERO: 1
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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8
TÍTULO: Stretch triggers microtubule stabilization and MARCKS-dependent membrane incorporation in the shaft of embryonic axons
AUTORES: Sousa, Sara C.; Aroso, Miguel; Bessa, Rita; Verissimo, Eduardo; Silva, Tiago Ferreira da; Lopes, CDF; Brites, Pedro; Vieira, Jorge ; Vieira, Cristina P. ; Aguiar, Paulo C. ; Sousa, Monica M.;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: CURRENT BIOLOGY, VOLUME: 34, NÚMERO: 19
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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9
TÍTULO: Auto-phylo: A Pipeline Maker for Phylogenetic Studies
AUTORES: Hugo López Fenández; Miguel Pinto; Cristina Vieira; Pedro Duque; Miguel Reboiro Jato; Jorge Vieira ;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: 17th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2023 in Lecture Notes in Networks and Systems, VOLUME: 743 LNNS
INDEXADO EM: Scopus CrossRef: 4
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10
TÍTULO: EvoPPI 2: A Web and Local Platform for the Comparison of Protein–Protein Interaction Data from Multiple Sources from the Same and Distinct Species
AUTORES: Reboiro Jato, M; Vieira, J ; Rocha, S; Sousa, AD; López Fernández, H; Vieira, CP;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: 16th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2022 in Lecture Notes in Networks and Systems, VOLUME: 553
INDEXADO EM: Scopus CrossRef: 1
NO MEU: CIÊNCIAVITAE
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