Jorge Manuel de Sousa Basto Vieira


AuthID: R-000-7S2

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TÍTULO: GULO Evolution in Bats: A Genomic Approach
AUTORES: Cristina Vieira ; Hugo López Fernández; Miguel Reboiro Jato; Jorge Vieira ;
PUBLICAÇÃO: 2026, FONTE: 19th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2025 in Lecture Notes in Networks and Systems, VOLUME: 1720 LNNS
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2
TÍTULO: Simplifying Bioinformatics Analyses with docknrun
AUTORES: Miguel Reboiro Jato; Diogo Adão; Pablo González González; Cristina Vieira; Hugo López Fernández; Ricardo Soares; Jorge Vieira ;
PUBLICAÇÃO: 2026, FONTE: 19th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2025 in Lecture Notes in Networks and Systems, VOLUME: 1720 LNNS
INDEXADO EM: Scopus CrossRef
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3
TÍTULO: Continent-wide differentiation of fitness traits and patterns of climate adaptation among European populations of Drosophila melanogaster
AUTORES: Durmaz Mitchell, Esra; Kerdaffrec, Envel; Harney, Ewan; Paulo, Tania F.; Veselinovic, Marija Savic; Tanaskovic, Marija; Tyukmaeva, Venera; de Arcaya, Teresa Abaurrea Fernandez; Aksoy, Cansu; Argyridou, Eliza; Bailly, Tiphaine P. M.; Can, Dogus; Cobanoglu, Ezgi; Cook, Nicola; Coskun, Seda; Davidovic, Slobodan; Demir, Ekin; Dias, Tania; Rasouli Dogaheh, Somayeh; Duque, Pedro; Eric, Katarina; Eric, Pavle; Erickson, Priscilla; Filipovski, Filip; Fishman, Bettina; Glaser Schmitt, Amanda; Goldfischer, August; Green, Llewellyn; Janillon, Sonia; Jelic, Mihailo; Kostic, Hristina; Kreiman, Lucas E.; Kremer, Natacha; Lyrakis, Manolis; Maistrenko, Oleksandr M.; Marti, Sapho Lou; Mcgunnigle, Megan; Merenciano, Miriam; Mira, Mario S.; Montbel, Vincent; Mouton, Laurence; Mukha, Dmitry, V; Murali, Siddharth; Patenkovic, Aleksandra; Protsenko, Oleksandra; Putero, Florencia A.; Reis, Micael; Roshina, Natalia, V; Rybina, Olga Y.; Schou, Mads F.; Schowing, Thibault; Senkal, Senel Selin; Serga, Svitlana; Trieu, Virginie; Symonenko, Alexander, V; Trostnikov, Mikhail, V; Tsybul'ko, Evgenia A.; van den Heuvel, Joost; van Waarde, David; Veselkina, Ekaterina R.; Vieira, Cristina P.; Wang, Xiaocui; Zandveld, Jelle; Abbott, Jessica; Billeter, Jean Christophe; Colinet, Herve; Ebrahimi, Mehregan; Gibert, Patricia; Hrcek, Jan; Kankare, Maaria; Kozeretska, Iryna; Loeschcke, Volker; Mensch, Julian; Onder, Banu Sebnem; Parsch, John; Pasyukova, Elena G.; Stamenkovic Radak, Marina; Tauber, Eran; Vieira, Cristina; Wegener, Christian; Hoedjes, Katja M.; Zwaan, Bas J.; Betancourt, Andrea J.; Fricke, Claudia; Grath, Sonja; Posnien, Nico; Vieira, Jorge ; Kapun, Martin; Schloetterer, Christian; Schmidt, Paul; Sucena, Elio; Gonzalez, Josefa; Bergland, Alan; Ritchie, Michael G.; Flatt, Thomas; ...Mais
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: EVOLUTION LETTERS, VOLUME: 9, NÚMERO: 4
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4
TÍTULO: Patterns of Recombination in Coronaviruses  Full Text
AUTORES: Soares, Ricardo; Vieira, Cristina P.; Vieira, Jorge ;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, VOLUME: 26, NÚMERO: 12
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5
TÍTULO: PPI Prediction from Sequences via Transfer Learning on Balanced but yet Biased Datasets: An Open Problem
AUTORES: Alba Nogueira Rodríguez; Daniel Glez Peña; Cristina Vieira; Jorge Vieira ; Hugo López Fernández;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: 18th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2024 in Lecture Notes in Networks and Systems, VOLUME: 1350 LNNS
INDEXADO EM: Scopus CrossRef: 3
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6
TÍTULO: Predicting Which Mitophagy Proteins Are Dysregulated in Spinocerebellar Ataxia Type 3 (SCA3) Using the Auto-p2docking Pipeline  Full Text
AUTORES: Vieira, Jorge ; Barros, Mariana; Lopez Fernandez, Hugo; Glez Pena, Daniel; Nogueira Rodriguez, Alba; Vieira, Cristina P. ;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, VOLUME: 26, NÚMERO: 3
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7
TÍTULO: Towards a more accurate and reliable evaluation of machine learning protein-protein interaction prediction model performance in the presence of unavoidable dataset biases
AUTORES: Nogueira Rodriguez, Alba; Glez Pena, Daniel; Vieira, Cristina P. ; Vieira, Jorge ; Lopez Fernandez, Hugo;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, VOLUME: 22, NÚMERO: 2
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8
TÍTULO: Auto-phylo v2 and auto-phylo-pipeliner: building advanced, flexible, and reusable pipelines for phylogenetic inferences, estimation of variability levels and identification of positively selected amino acid sites
AUTORES: Lopez Fernandez, Hugo; Pinto, Miguel; Vieira, Cristina P. ; Duque, Pedro; Reboiro Jato, Miguel; Vieira, Jorge ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, VOLUME: 21, NÚMERO: 2
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9
TÍTULO: Inferences on the evolution of the ascorbic acid synthesis pathway in insects using Phylogenetic Tree Collapser (PTC), a tool for the automated collapsing of phylogenetic trees using taxonomic information
AUTORES: Glez Pena, Daniel; Lopez Fernandez, Hugo; Duque, Pedro; Vieira, Cristina P.; Vieira, Jorge ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, VOLUME: 21, NÚMERO: 2
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10
TÍTULO: Multiple Lines of Evidence Support 199 SARS-CoV-2 Positively Selected Amino Acid Sites  Full Text
AUTORES: Ferreira, Pedro ; Soares, Ricardo; Lopez Fernandez, Hugo; Vazquez, Noe; Reboiro Jato, Miguel; Vieira, Cristina P.; Vieira, Jorge ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, VOLUME: 25, NÚMERO: 4
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