1
TÍTULO: A Novel Deep Learning Framework for Predicting Antimicrobial Peptide Activity Using ProtBert and Neural Networks
AUTORES: Abbasi, Maryam; Vasconcelos, Veronica ; Vicente, Edgar M. C. O. S.; Santos, Ana L. M.; Arrais, Joel P.;
PUBLICAÇÃO: 2026, FONTE: 12th Iberian Conference on Pattern Recognition and Image Analysis-IbPRIA in PATTERN RECOGNITION AND IMAGE ANALYSIS, IBPRIA 2025, PT II, VOLUME: 15938
INDEXADO EM: Scopus WOS DBLP CrossRef
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2
TÍTULO: Rethinking transformers with convolution and graph embeddings for few-shot molecular property discovery
AUTORES: Luis H M Torres; Joel P Arrais; Bernardete Ribeiro;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: Pattern Recognit., VOLUME: 166
INDEXADO EM: Scopus DBLP CrossRef
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3
TÍTULO: CNN Models in Prediction of Feno Type from Genotype
AUTORES: Guilherme Henriques; Maryam Abbasi; Daniel Martins; Joel Arrais;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: 18th International Conference on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics, PACBB 2024 in Lecture Notes in Networks and Systems, VOLUME: 1350 LNNS
INDEXADO EM: Scopus CrossRef
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4
TÍTULO: Integrating AI and genomics: predictive CNN models for schizophrenia phenotypes
AUTORES: Henriques, Guilherme; Abbasi, Maryam; Martins, Daniel; Arrais, Joel P.;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, VOLUME: 22, NÚMERO: 2
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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5
TÍTULO: Deep learning for small-molecule drug discovery: From molecular design to clinical translation
AUTORES: Rita I Oliveira; Tiago O Pereira; Maryam Abbasi; Jorge A.R Salvador; Joel P Arrais;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: Journal of Pharmaceutical Analysis
INDEXADO EM: CrossRef
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6
TÍTULO: TAG-DTA: Binding-region-guided strategy to predict drug-target affinity using transformers
AUTORES: Monteiro, Nelson R. C.; Oliveira, Jose L.; Arrais, Joel P.;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: EXPERT SYSTEMS WITH APPLICATIONS, VOLUME: 238
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 2
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7
TÍTULO: Detecting outliers in case-control cohorts for improving deep learning networks on Schizophrenia prediction
AUTORES: Martins, Daniel; Abbasi, Maryam; Egas, Conceicao; Arrais, Joel P.;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS, VOLUME: 21, NÚMERO: 2
INDEXADO EM: Scopus WOS
8
TÍTULO: A Hybrid GNN Approach for Improved Molecular Property Prediction
AUTORES: Quesado, Pedro; Torres, Luis H. M.; Bernardete Ribeiro ; Arrais, Joel P.;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, VOLUME: 31, NÚMERO: 11
INDEXADO EM: Scopus WOS DBLP
10
TÍTULO: Combining graph neural networks and transformers for few-shot nuclear receptor binding activity prediction  Full Text
AUTORES: Torres, Luis H. M.; Arrais, Joel P.; Bernardete Ribeiro ;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: JOURNAL OF CHEMINFORMATICS, VOLUME: 16, NÚMERO: 1
INDEXADO EM: Scopus WOS DBLP
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