António José Meireles Ribeiro


AuthID: R-000-W64

Publicações Confirmadas: 41



1
TÍTULO: Measuring catalytic mechanism similarity - a new approach to study enzyme function and evolution  Full Text
AUTORES: Ribeiro, Antonio J. M. ; Riziotis, Ioannis G.; Borkakoti, Neera; Fernandes, Pedro A.; Ramos, Maria J.; Thornton, Janet M.;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: FEBS JOURNAL, VOLUME: 292, NÚMERO: 16
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef: 1
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2
TÍTULO: Off the beaten (catalytic) path: Charting the mechanistic space of enzyme reactions  Full Text
AUTORES: Ribeiro, Antonio J. M. ; Fernandes, Pedro A. ; Ramos, Maria J. ;
PUBLICAÇÃO: 2025, FONTE: JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, VOLUME: 163, NÚMERO: 13
INDEXADO EM: Scopus WOS CrossRef
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3
TÍTULO: Paradigms of convergent evolution in enzymes  Full Text
AUTORES: Ioannis G Riziotis; Jenny C Kafas; Gabriel Ong; Neera Borkakoti; António J M Ribeiro ; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2024, FONTE: The FEBS Journal
INDEXADO EM: CrossRef
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4
TÍTULO: Enzyme function and evolution through the lens of bioinformatics
AUTORES: Antonio J M Ribeiro ; Ioannis G Riziotis; Neera Borkakoti; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: Biochemical Journal, VOLUME: 480, NÚMERO: 22
INDEXADO EM: CrossRef
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5
TÍTULO: EzMechanism: an automated tool to propose catalytic mechanisms of enzyme reactions
AUTORES: Antonio J M Ribeiro ; Ioannis G Riziotis; Jonathan D Tyzack; Neera Borkakoti; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: Nature Methods, VOLUME: 20, NÚMERO: 10
INDEXADO EM: CrossRef: 1
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6
TÍTULO: The 3D Modules of Enzyme Catalysis: Deconstructing Active Sites into Distinct Functional Entities  Full Text
AUTORES: Ioannis G Riziotis; António J.M Ribeiro ; Neera Borkakoti; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2023, FONTE: Journal of Molecular Biology, VOLUME: 435, NÚMERO: 20
INDEXADO EM: CrossRef: 3
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7
TÍTULO: EzMechanism: An Automated Tool to Propose Catalytic Mechanisms of Enzyme Reactions
AUTORES: Antonio J M Ribeiro ; Ioannis G Riziotis; Jonathan D Tyzack; Neera Borkakoti; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2022
INDEXADO EM: CrossRef: 2
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8
TÍTULO: GRaSP-web: a machine learning strategy to predict binding sites based on residue neighborhood graphs  Full Text
AUTORES: Charles A Santana; Sandro C Izidoro; Raquel C de Melo-Minardi; Jonathan D Tyzack; António J M Ribeiro ; Douglas E V Pires; Janet M Thornton; Sabrina de A. Silveira;
PUBLICAÇÃO: 2022, FONTE: Nucleic Acids Research, VOLUME: 50, NÚMERO: W1
INDEXADO EM: CrossRef: 6
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9
TÍTULO: Using mechanism similarity to understand enzyme evolution  Full Text
AUTORES: António J M Ribeiro ; Ioannis G Riziotis; Jonathan D Tyzack; Neera Borkakoti; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2022, FONTE: Biophysical Reviews, VOLUME: 14, NÚMERO: 6
INDEXADO EM: CrossRef: 6
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10
TÍTULO: Conformational variation in enzyme catalysis: A structural study on catalytic residues
AUTORES: Ioannis G Riziotis; António J M Ribeiro ; Neera Borkakoti; Janet M Thornton;
PUBLICAÇÃO: 2021
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